20
06月
2023
TENSE函数是一种用于时间序列聚类的算法,它可以将时间序列划分为具有相似特征的群组。下面是使用Python实现TENSE函数进行聚类的示例代码。
首先,我们需要导入必要的库和数据集。在这个示例中,我们将使用UCR Time Series Archive中的TwoLeadECG数据集。
```python
import numpy as np
import pandas as pd
from sklearn.cluster import KMeans
from scipy.spatial.distance import cdist
# Load dataset
data = pd.read_csv('TwoLeadECG.csv', header=None)
```
接下来,我们需要定义TENSE函数。TENSE函数的核心思想是通过计算时间序列的斜率和曲率来捕捉其形状特征。我们可以使用numpy的diff函数计算时间序列的一阶和二阶差分,然后将它们平方并求和,以获得斜率和曲率。最后,我们将斜率和曲率加权并归一化,得到单个时间序列的TENSE向量。
```python
def tense(ts):
# Compute first and second order differences
d1 = np.diff(ts)
d2 = np.diff(d1)
# Compute slope and curvature
m = np.sum(d1**2)
c = np.sum(d2**2)
# Compute TENSE vector
tense_vec = np.array([m, c])
tense_vec /= np.sqrt(np.sum(tense_vec**2))
return tense_vec
```
现在,我们可以使用TENSE函数计算每个时间序列的TENSE向量,并将它们组合成一个矩阵。然后,我们可以使用KMeans算法对TENSE向量进行聚类,并使用肘部法则确定最佳聚类数量。
```python
# Compute TENSE vectors for all time series
tense_matrix = np.array([tense(row) for _, row in data.iterrows()])
# Apply KMeans clustering
distortions = []
K = range(1, 10)
for k in K:
kmeans = KMeans(n_clusters=k).fit(tense_matrix)
distortions.append(sum(np.min(cdist(tense_matrix, kmeans.cluster_centers_, 'euclidean'), axis=1)) / tense_matrix.shape[0])
# Determine optimal number of clusters using elbow method
optimal_k = np.argmin(np.diff(distortions)) + 1
# Perform KMeans clustering with optimal number of clusters
kmeans = KMeans(n_clusters=optimal_k).fit(tense_matrix)
labels = kmeans.labels_
```
最后,我们可以将聚类结果可视化,以便更好地理解它们。
```python
import matplotlib.pyplot as plt
# Plot clusters
colors = ['r', 'g', 'b', 'y', 'c', 'm']
for i in range(optimal_k):
plt.scatter(data.iloc[labels==i, 0], data.iloc[labels==i, 1], c=colors[i%len(colors)], label=f'Cluster {i+1}')
plt.legend()
plt.title('TENSE Clustering Results')
plt.xlabel('Time')
plt.ylabel('Amplitude')
plt.show()
```
这是一个简单的示例,演示了如何使用TENSE函数进行时间序列聚类。当然,实际应用中可能需要更多的调整和优化,以便获得最佳的聚类结果。
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本文标题: 使用TENSE函数画出聚类结果python代码
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